כאחד ממחנות עבודה רבים שהוקמו בדרום-מערב גרמניה בשלב הסופי של המלחמה והיו כפופים בדרך כלל למחנה הריכוז נאצוויילר באלזס, שימש מחנה הריכוז ביסינגן לייצור חימוש. מאוגוסט 1944 ועד מרץ 1945 גורשו לביסינגן 4,150 גברים, בהם כ-1,500 יהודים. הם הגיעו כמעט מכל מדינות אירופה והגיעו לתחנה בכמה "קבוצות". עבור רוב האסירים, ביסינגן הייתה רק עצירה בדרך הארוכה והנוראה שהביאה אותם דרך מחנות הריכוז וההשמדה הגדולים של דכאו, אושוויץ, דנזיג-שטוטהוף ובוכנוואלד למחנות של חברת "המדבר" (Wüste).
כאשר גורשו אלף האסירים הראשונים מאושוויץ לביסינגן ב-24 באוגוסט 1944, המחנה עדיין לא היה ממוקם. האסירים היו צריכים לבנות צריפים, מגדלי שמירה, גדרות תיל, להניח צינור מים ולהקים את תחנות העבודה של פצלי השמן בקוהלוך. ב"תחנת המדבר 2" (Wüste-Werk 2) ובאתר הכרייה השני ליד אנגסטלאט ("מדבר 3") נאלצו האסירים לשבור את הלוח מתוך הסלע בכלים הפשוטים ביותר. רק ב-23 בפברואר 1945, "כבשן" הראשון הוצתה ונפט יצא מן הלוח. התפוקה הייתה נמוכה; מעט דלק התאושש עד שהמחנה חוסל.
בנוסף לכריית צפחה, האסירים שימשו לעבודה אחרת. חלק מהגברים "הושאלו" על ידי מפעל הנעליים קלר, נשלחו לתקן את גג הכנסייה שניזוק בפשיטה אווירית, או לפנות את ההריסות מבתי שהופצצו. בהזדמנויות אלה, אוכלוסיית ביסינגן הצליחה לראות את חלקם של החיים האומללים של האסירים; הם יכלו גם לשים לב לקשיים של האסירים במהלך צעדת העובדים היומית אל תחנת המדבר 3, שהובילה את האסירים לאורך הכביש הראשי פעמיים ביום. אזרחים בודדים של ביסינגן ניסו לעזור לאסירים החמושים על ידי הצבת פריטי מזון לאורך המסלול.
העבודה הקשה בתחנות העבודה של פצלי השמן, תת-התזונה והתנאים הלא היגייניים במחנה גבו קורבנות רבים, במיוחד בסתיו ובחורף הרטובים במיוחד של 1944/45. האסירים שקעו עד הברכיים בבוץ, הם לא יכלו להשאר יבשים ונקיים, ומגיפות פרצו. אסירים רבים מתו ממחלות, חולשה, תת-תזונה והתעללות מדי יום. במהלך פעולות ענישה וכגורם מרתיע, אסירים נורו או נתלו על ידי אנשי אס אס, בעיקר מסיבות טריוויאליות.
29 ההרוגים הראשונים מהמחנה נשרפו במשרפה בראוטלינגן. מאוחר יותר, שני גברים ביסינגן נאלצו להסיע את הגופות בעגלות רתומות לסוסים לקברי אחים באזור לודנסטול, ולקבור אותם שם. בשמונת חודשי קיומו של מחנה הריכוז ביסינגן נהרגו לפחות 1187 בני אדם, מתוכם 1158 קבורים בבית הקברות של מחנה הריכוז כיום. בעקבות פקודתו של הרייכספיהרר של האס אס, היינריך הימלר, לפנות את כל המחנות לפני שבעלות הברית התקרבו, פירק האס אס את מחנה הריכוז ביסינגן באפריל 1945. הם שלחו 769 אסירים בשני משלוחים לדכאו-אלאך, והשאר הונחו ברגל על "צעדת המוות" בכיוון שוואביה העליונה ובוואריה, שבמהלכה מתו רבים. אסירי מחנות הריכוז ששרדו שוחררו בדכאו: ליד אוסטרץ', אלטסהאוזן או גרמיש-פרטנקירכן.
לאחר תום מלחמת העולם השנייה הורה הכוח הכובש הצרפתי להוציא את המתים מקבר האחים ביסינגן ולקבור אותם בנפרד בארונות קבורה בבית הקברות החדש שנוצר. עבודה זו נעשתה על ידי אסירים במחנות פשעי המלחמה רויטלינגן ובאלינגן. פקידים נאציים לשעבר מכל המחוזות של השטח הכבוש על ידי צרפת הובאו לביסינגן כדי לראות בעצמם את הזוועות במחנה הריכוז ביסינגן. בית הקברות של מחנה הריכוז ביסינגן הוקם באפריל 1947. פעולה זו סימנה את הצעד הראשון – ובמשך זמן רב היחיד – להנצחת ההיסטוריה של מחנה הריכוז ביסינגן וקורבנותיו.